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Id:PE14.1
Autor:Huguet Tapia, José Carlos; Arias Bustamante, Isabel; Montoya Piedra, Ysabel Catalina.
Título:Tipificación molecular del Vibrio cholerae 01 en el Perú^ies / Molecular typification of Vibrio cholerae 01 from Peru
Fuente:Rev. med. exp;17(1-4):9-13, ene.-dic 2000. ^bilus, ^btab.
Resumen:Este estudio de ribotipificación en 75 cepas de Vibrio cholerae 01 permitió identificar tres variantes ribotípicas, referidas como Per1, Per2 y Per3, aisladas durante el periodo 1991-1999 en el Perú. La variante Per1 fue reportada tanto en la etapa epidémica y endémica del cólera, mientras que Per2 y Per3 se relacionan sólo con la etapa endémica. Los resultados mostraron además una aparición constante y mayoritaria de la variante Per1, poniendo en evidencia la emergencia de un mismo grupo clonal en los brotes epidémicos del Perú. Las variantes ribotípicas encontradas fueron comparadas con los ribotipos de diferentes cepas referenciales de V. cholerae previamente caracterizadas. Se observó una identidad total del ribotipo Per1 con la variante ribotípica de aislamientos Asiáticos (Tailandia), encontrándose además altos índices de similitud entre los ribotipos Per1, Per2 y Per3, y evidenciándose una estrecha relación entre las cepas peuansa y los aislamientos asiáticos. (AU)^ies.
Descriptores:Vibrio cholerae
ARN Ribosomal
Perú
Localización:PE14.1

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Id:PE1.1
Autor:Trelles Montero, Luis Antonio; Quesada G., María de los Angeles.
Título:La neurogenética: pasado, presente y futuro^ies / Neurogenetics: past, present and future
Fuente:Rev. neuropsiquiatr;52(4):168-188, dic. 1989. ^btab, ^bilus.
Resumen:La genética en general y la neurogenética en particular han tenido en los últimos años un espectacular desarrollo, que se expone de manera esquemática. Para ello se divide el artículo en tres fases: el pasado, el presente y el futuro. En la primera se describe la historia de la neurogenética; en la segunda se describe los métodos de la genética molecular que han permitido su actual desarrollo y se resume los hallazgos sobre algunas enfermedades como la enfermedad de Duchenne. La tercera parte trata sobre las implicancias futuras que tendrá la neurogenética (AU)^ies.
Descriptores:Genética
ADN
ARN
Polimorfismo Genético
Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción
Diagnóstico Prenatal
Enfermedad de Huntington
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Ramirez, Jorge; Ramirez Mesías, Rina Lastenia.
Título:Analysis of the secondary structure of mitochondrial LSU rRNA of Peruvian land snails (Orthalicidae: Gastropoda)^ien.
Fuente:Rev. peru. biol;17(1):53-57, abr. 2010. ^bilus, ^btab.
Resumen:The alignment of ribosomal genes is difficult due to insertion and deletion events of nucleotides, making the alignment ambiguous. This can be overcome by using information from the secondary structure of ribosomal genes. The aim of this study was to evaluate the utility of the secondary structure in improving the alignment of the 16S rRNA gene in land snails of the family Orthalicidae. We assessed 10 Orthalicid species (five genera).Total DNA was isolated and the partial 16S rRNA gene was amplified and sequenced using internal primers. The sequences were aligned with ClustalX and manually corrected, in DCSE format, using the 16S rRNA secondary structure of Albinaria caerulea (Pulmonata: Clausiliidae). The sequences obtained ranged from 323 to 345 bp corresponding to parts of both domains IV and V of the 16S rRNA gene. The secondary structure was recovered by homology using RnaViz 2.0. Most stems are conserved, and in general the loops are more variable. The compensatory mutations in stems are related to maintenance of the structure. The absence of abulge-stem-loop in domain V places the family Orthalicidae within the Heterobranchia. (AU)^ienEl alineamiento de genes ribosomales es dificultoso debido a eventos de inserción y deleción de nucleótidos, convirtiendo el alineamiento en ambiguo; esto puede ser superado utilizando la información de la estructura secundaria. El objetivo del presente trabajo es evaluar la utilidad de la estructura secundaria en mejorar el alineamiento del gen 16S rRNA de caracoles terrestres de la familia Orthalicidae. Se evaluaron 10 especies de Orthalicidos (5 géneros). El ADN total fue aislado y parte del gen 16S rRNA fue amplificado y secuenciado usando primers internos. Las secuencias fueron alineadas con ClustalX y corregidas a mano, en formato DCSE, usando la estructura secundaria del 16S rRNA de Albinaria caerulea (Pulmonata: Clausiliidae). Las secuencias obtenidas variaron de 323 a 345 pb correspondiendo a partes del dominio IV y V del gen 16S rRNA. Se pudo recuperar por homología la estructura secundaria para los Orthalicidos usando RnaViz 2.0. La mayoría de las hélices son conservadas, siendo en general los bucles más variables. El fenómeno de mutaciones compensatorias en las hélices, estaría relacionado con la conservación de la estructura. La ausencia de un“bulge-stem-loop” en el dominio V ubica a la familia Orthalicidae dentro de Heterobranchia. (AU)^ies.
Descriptores:Caracoles
Caracoles/clasificación
ARN/análisis
Perú
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rpb/v17n1/a06v17n1.pdf / en
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Chirinos, Jenny; Congrains, Carlos; Ramírez Mesías, Rina Lastenia; Ramírez Roca, Pablo Sergio.
Título:Identificación de Yarrowia lipolytica (Ascomycota: Hemiascomycetes) como contaminante en la obtención de amplificados del gen 28S rRNA de moluscos^ies / Identification of Yarrowia lipolytica (Ascomycota: Hemiascomycetes) as a contaminant in obtaining amplified 28S rRNA gene of mollusks
Fuente:Rev. peru. biol;17(1):59-64, abr. 2010. ^bilus, ^btab.
Resumen:En el presente trabajo se identifica una secuencia de DNA no esperada proveniente de los amplificados del gen 28S rRNA de moluscos terrestres. Las extracciones de DNA se realizaron del tejido del pie de caracoles terrestres por el método del CTAB modificado. Las PCRs fueron llevadas a cabo con primers universales para el gen COI e iniciadores diseñados para moluscos, para el marcador 16S rRNA, 28S rRNA y la región ITS-2. Los tamaños aproximados de las bandas de los amplificados de moluscos fueron de 706 pb para el COI, 330pb para el 16S rRNA, 900 pb para el ITS-2 y 583 pb para el 28S rRNA; un amplificado del último marcador fuede una longitud inesperada, ~340 pb. Las secuencias de DNA fueron comparadas con la base de datos del GenBank mediante el programa BLASTn y la muestra con la banda de tamaño inesperado resultó en un 100% de identidad y cobertura del 99% con el gen 26S rRNA de la levadura Yarrowia lipolytica. El análisis filogenético con Neighbour-Joining y los valores de divergencia confirmaron la identificación, proporcionando resultados que apoyan la ubicación taxonómica de la especie dentro del clado de los Hemiascomycetes. (AU)^iesIn this paper we identify an unexpected DNA sequence from the amplicons of 28S rRNA gene of terrestrial mollusks. DNA extractions were performed from foot tissues of land snails using a modified CTAB protocol. PCRs were carried out with universal primers for COI gene and oligonucleotides designed for molluscs, for the markers 16S rRNA, 28S rRNA, and ITS-2. Amplified lengths were 706 pb for COI, 330 pb for 16S rRNA, 900 pbfor ITS-2, and 583 pb for 28S rRNA. One amplicon of the last marker was of an unexpected length, ~340 pb. DNA sequences were compared in the GenBank database through the BLASTn program and the sample, with the unexpected length, resulted in 100% identity and 99% query coverage with 26S rRNA gene of the yeast Yarrowia lipolytica. Phylogenetic analysis with Neighbour-Joining and the divergence values confirmed the identification, providing results that support the taxonomic placement of the species within the Hemiascomycetes clade.^ien.
Descriptores:Yarrowia
Ascomicetos
ARN
ADN
Gastrópodos
Caracoles
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rpb/v17n1/a07v17n1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Araínga Ramírez, Mariluz Anamelva; Rivera Gerónimo, Hermelinda; Huamán Gonzáles, Juan Carlos; Manchego Sayán, Alberto Gustavo.
Título:Fenotipo y genotipo del virus de la diarrea viral aislado de bovinos en el Perú^ies / Phenotype and genotype of bovine viral diarrhoea virus isolated in peruvian cattle
Fuente:Rev. invest. vet. Perú;21(2):192-203, jul.-dic. 2010. ^bilus.
Resumen:El objetivo del presente estudio fue determinar el fenotipo y genotipo de cepas del Virus de la Diarrea Viral Bovina (VDVB) aisladas de bovinos de diversos lugares del Perú. Entre 1998 y 2007 se colectó muestras de tejidos de fetos abortados, sangre, suero o plasma de bovinos con infección aguda o portadores del virus procedente de las principales cuencas lecheras del país para la búsqueda del antígeno del VDVB mediante inmunofluorescencia y ELISA de captura. Las muestras positivas al antígeno viral fueron cultivadas en monocapas de células de cornete nasal de feto bovino (CNB), libre del VDVB hasta el tercer pasaje, para determinar el biotipo. Las muestras positivas, tanto de los tejidos como del tercer pasaje, fueron procesadas por la técnica RT-PCR en tiempo real, para determinar el genotipo viral. Se aislaron 41 cepas del VDVB en CNB. El 85.4% (35/41) correspondieron al fenotipo no citopático y 14.6% (6/41) al citopático. El 45.5% (25/55) y el 74.5% (41/55) de las muestras de tejidos y del 3er pasaje en CNB, respectivamente, resultaron positivas al VDVB mediante la técnica de RT-PCR en tiempo real. Todas las cepas pertenecieron al VDVB-1. Los resultados enriquecen la epidemiología de la DVB en el país y sugieren la ausencia o baja prevalencia de cepas del VDVB-2 en la población bovina de las principales cuencas lecheras. (AU)^iesThe aim of this study was to determine the phenotype and genotype of Bovine Viral Diarrhoea Virus (BVDV) in Peruvian cattle. During the period 1998-2007, tissues of aborted foetus, blood, serum or plasma samples of bovine with acute infection or persistently infected from dairy herds of various locations in the country were collected and the BVDV antigen was detected by immnunofluorescence or capture ELISA tests, and positivesamples were inoculated en BVDV free BT cells and cultured until third passage to determine the biotype. Both animal tissues and third passage of positive samples were tested by a Real Time Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for genotyping the strains. Forty one BVDV strains were isolated in BT cells. Eighty five percent (35/41) of the isolates were non-cytopathic and 14.6% (6/41) cytophatic. Forty five and a half percent (25/55) and 74.5% (41/55) of the animal tissues and from the 3rd passage samples respectively, were positive to BVDV by Real Time RT-PCR test. All isolates belonged to BVDV-1 genotype. These results contribute to a better understanding of the epidemiology of the bovine viral diarrhoea disease in Peru and suggest that BVDV-2 is absent or has low prevalence in dairy herds. (AU)^ien.
Descriptores:Virus de la Diarrea Viral Bovina/genética
Fenotipo
Genotipo
ARN
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Técnicas de Cultivo de Célula
Bovinos
Perú
Límites:Animales
Medio Electrónico:http://sisbib.unmsm.edu.pe/BVRevistas/veterinaria/v21_n2/pdf/a08v21n2.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Ramírez Mesías, Rina Lastenia; Borda, Victor; Romero, Pedro; Ramirez, Jorge; Congrains, Carlos; Chirinos, Jenny; Ramírez Roca, Pablo Sergio; Velásquez, Luz Elena; Mejía Carhuanca, Kember Mateo.
Título:Biodiversidad y endemismo de los caracoles terrestres Megalobulimusy Systrophia en la Amazonia occidental^ies / Biodiversity and endemism of the western Amazonia land snails Megalobulimus and Systrophia
Fuente:Rev. peru. biol;19(1):59-74, abr. 2012. ^bilus, ^btab.
Resumen:En este trabajo realizamos un estudio biogeográfico de dos géneros de caracoles terrestres amazónicos, Megalobulimus (Strophocheilidae) y Systrophia (Scolodontidae). Se utilizaron individuos colectados en diversas localidades de la Amazonia peruana así como información bibliográfica. Se utilizaron los marcadores moleculares 5.8S-ITS2-28S rRNA y 16S rRNA para reconstruir filogenias y obtener hipótesis sobre las relaciones evolutivas entre los géneros amazónicos y otras especies de distribución global. La filogenia nuclear permitió determinar la posición evolutiva de ambos géneros y la filogenia mitocondrial permitió la diferenciación de las especies a nivel intragenérico. Megalobulimus formó parte del clado no-achatinoideo en la filogenia de los gastrópodos Stylommatophora, como lo esperado, pero no pudo ser demostrada su cercanía a la familia Acavidae, mientras que Systrophia quedó fuera de los dos clados establecidos, formando uno basal dentro de los Stylommatophora. El gen mitocondrial 16S rRNA permitió diferenciar a las especies de Megalobulimus, actuando como código de barras de ADN de estos caracoles comestibles. El análisis de distribución geográfica reveló varios endemismos para la Amazonia peruana para especies de ambos géneros, resaltando las unidades biogeográficas de Chanchamayo e Inambari. (AU)^iesIn this work we performed a biogeographic study of two genera of Amazonian land snails, Megalobulimus (Strophocheilidae) and Systrophia (Scolodontidae). We used samples from different regions of the Peruvian Amazon, as well as bibliographic information. We analyzed both nuclear (5.8S-ITS2-28S rRNA) and mitochondrial (16S rRNA) genes to reconstruct phylogenies and obtain hypotheses concerning the evolutionary relationships among Amazonian genera and other species with global distribution. The nuclear phylogeny allowed us to determine the evolutionary position of both genera, and the mitochondrial phylogeny permitted the differentiation of species at the intrageneric level. We found that Megalobulimus clustered with the non-achatinoid clade within Stylommatophora, as expected, but its relationship to family Acavidae could not be demonstrated. Systrophiadid not cluster with any of the two established clades, but formed a basal one within Stylommatophora. The mitochondrial gene 16S rRNA allowed us to differentiate Megalobulimus species, and performed well for DNA barcoding of these edible snails. Biogeographical analysis revealed several endemic species in the Peruvian Amazon within both genera, highlighting the Chanchamayo and Inambari biogeographic units. (AU)^ien.
Descriptores:Gastrópodos
Gastrópodos/clasificación
Biodiversidad
Filogenia
ARN Ribosómico 16S
Código de Barras del ADN Taxonómico
Ecosistema Amazónico
Límites:Animales
Medio Electrónico:http://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/rpb/article/view/798/635 / es
Localización:PE1.1

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Id:PE14.1
Autor:García Mendoza, María Paquita; Merino Sarmiento, Nancy Susy; Figueroa Romero, Maribel Dana; Marcelo Ñ., Adolfo; Tineo V., Edwin; Manrique Lara Estrada, Carlos Hermogenes; Donaires Toscano, Luis Fernando; Céspedes Zambrano, Manuel Jesus; Cabrera Champe, Rufino; Cabezas Sánchez, César Augusto.
Título:Detección de la circulación del virus Oropuche en la región Madre de Dios, Perú, (diciembre 2015 - enero 2016)^ies / Detection of Oropouche viral circulation in Madre de Dios region, Peru (december 2015 to january 2016)
Fuente:Rev. peru. med. exp. salud publica;33(2):380-381, abr.-jun. 2016. .
Descriptores:Virus ARN
Orthobunyavirus
Phlebovirus
Infecciones por Virus ARN
Estudios Transversales
 Estudios Retrospectivos
Límites:Humanos
Medio Electrónico:http://www.rpmesp.ins.gob.pe/index.php/rpmesp/article/view/2098/2134 / es
Localización:PE14.1



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