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Autor:Córdova Santa Gadea, Jesús Humberto; Sandoval Sandoval, José Raúl; Velásquez Reinoso, Margarita Rosa Eugenia; Távara Huere, Sergia Caleen; Cotos, Desiderio; Vásquez, Jaime; Barletta Carrillo, Claudia Fiorella; Fujita Alarcón, Ricardo; Descailleaux Dulanto, Ricardo Jaime.
Título:Poblamiento del continente americano y del Perú sugerido de un análisis filogeográfico de haplogrupos del mtDNA en etnias nativas I: inferencias primarias^ies / Peopling of the American continent and Peru as suggested from a phylogeographic mtDNA haplogroups analysis in native ethnoses. I: preliminary inferences
Fuente:Arch. biol. Andina;14(1):23-39, nov. 2008. ^btab, ^bmapas.
Resumen:OBJETIVOS: Precisar el origen de las poblaciones peruanas en un contexto filogeográfico, global y temporal. METODOS: Análisis comparativo de los resultados obtenidos a partir del procesamiento del mtDNA, de cinco poblaciones peruanas nativas sitas en Pucallpa, Taquile, Anapia, Amantani y Los Uros, con los resultados obtenidos por diferentes autores en la misma molécula (reciente y antigua) de 91 etnias–localidades, que incluyen varias del continente americano y algunas de nuestro país, y 13 del SE del continente asiático. Realizamos un análisis filogeográfico a partir de las frecuencias de los haplogrupos hallados por RFLPs y una secINDEL del mtDNA. Los datos fueron procesados por el programa PHYLIP 3.65 opción Distancias de Reynolds, para determinar los valores F de Diferenciación Genética o Coalescencia. El algoritmo UPGMA usó los valores de F entre pares de ST STetnias–localidades, para construir un árbol de distancias que permita el análisis de sus principales grupamientos(clusters). RESULTADOS: El árbol obtenido exhibe 7 clusters. El cluster 1 comprende a la etnia Han ubicada al SEde Asia, en tanto que las americanas se ubican entre los clusters 2 al 7. Las etnias menos diversas fueron dos: la Quechua (Taquile, Puno-Perú) – 100 por ciento haplotipo B - y la de los Kuna (Panamá) – 100 por ciento haplotipo A-.CONCLUSIONES: Los mayores valores encontrados de diferenciación genética, corresponden a los Yanomami, con un F de 0.23741, mientras que en el Perú fueron los Quechua de Taquile con un valor F de 0.16673. En ambos casos los resultados indican, según la tabla de calificación de valores F , una Divergencia Genética Alta. (AU)^iesOBJETIVES: To determine the origins of Peruvian populations in a more global and temporal phylogeographic context. METHODS: mtDNA results obtained in our laboratories from the analysis of the mtDNA from 5 native Peruvian populations that inhabit Pucallpa, Taquile, Anapia, Amantani and Los Uros, were compared with the results obtained different authors on the same molecule from 91 ethnoses-localities that include some of our country, others from the American continent, as well as 13 of the SE of the Asian continent. Phylogeographic analysis was done from the haplogroups frequencies found from the RFLPs and an INDEL sequence of mtDNA, and the data were processed by the program PHYLIP 3.65, option Distances of Reynolds to find F values of Genetic ST Differentiation or Coalescency. The UPGMA algorithm allowed us to express the values F between pairs of ST ethnoses-localities and to carry out the analysis of the main clusters, by means of a tree. RESULTS: The tree exhibit 7 main clusters. Cluster I comprised only the ethnos located to SE of Asia. The American ethnoses are located along the clusters 2 to 7. The less diverse ones were two: the Quechua from Taquile, (Puno-Peru) - 100 per cent B haplotype, and the Kuna from Panama, – 100 per cent A haplotype. CONCLUSIONS: Genetic differentiation larger values were in the Yanomami (0.23741) group. For Peru, they were in the Aymara ethnos from Taquile with F values of 0.16673. Both correspond to a High Genetic Divergence respect to the near closest ones. (AU)^ien.
Descriptores:ADN Mitocondrial
Población Indígena
Filogenia
Grupos Étnicos
Haplotipos
Perú
 Indios Norteamericanos
 Indios Sudamericanos
Límites:Humanos
Masculino
Femenino
Medio Electrónico:http://sisbib.unmsm.edu.pe/BVRevistas/abiola/2008_v14/pdf/a04v14n1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Autor:Ramirez, Jorge; Ramírez Mesías, Rina Lastenia; Romero, Pedro; Chumbe, Ana; Ramírez Roca, Pablo Sergio.
Título:Posición evolutiva de caracoles terrestres peruanos (Orthalicidae) entre los Stylommatophora (Mollusca: Gastropoda)^ies / Evolutionary position of Peruvian land snails (Orthalicidae) among Stylommatophora (Mollusca: Gastropoda)
Fuente:Rev. peru. biol;16(1):51-56, ago. 2009. ^bilus, ^btab.
Resumen:Los géneros Bostryx y Scutalus (Orthalicidae: Bulimulinae) son endémicos de América del Sur y están principalmente distribuidos en la vertiente occidental de los Andes del Perú. El objetivo del presente trabajo fue evaluar su posición evolutiva dentro de los gastrópodos Stylommatophora basada en el marcador mitocondrial 16S rRNA. Fueron obtenidas cuatro secuencias las que, junto con 28 de otros Stylommatophora disponibles en el GenBank, fueron alineadas con ClustalX. La reconstrucción filogenética se realizó mediante los métodos de Neighbor-Joining, Máxima Parsimonia, Máxima Verosimilitud e Inferencia Bayesiana. El alineamiento resultó en 371 sitios, con presencia de indels. Los dos géneros de la Familia Orthalicidae por primera vez incluidos en una filogenia molecular (Bostryx y Scutalus), formaron un grupo monofilético con otro miembro de la superfamilia Orthalicoidea (Placostylus), tal como lo obtenido con marcadores nucleares. Se discute también su relación evolutiva con otros caracoles terrestres. (AU)^iesThe genera Bostryx and Scutalus (Orthalicidae: Bulimulinae) are endemics from South America. They are mainly distributed on the western slopes of the Peruvian Andes. The goal of the present work was to assess their evolutionary position among the stylommatophoran gastropods based on the 16S rRNA mitochondrial marker. Four sequences were obtained, and along with 28 sequences of other Stylommatophora retrieved from the GenBank, were aligned with ClustalX. The phylogenetic reconstruction was carried out using the methods of Neighbor-Joining, Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian inference. The multiple sequence alignment had 371 sites, with indels. The two genera of the family Orthalicidae for the first time included in a molecular phylogeny (Bostryx and Scutalus), formed a monophyletic group along with another member of the superfamily Orthalicoidea (Placostylus), result that is comparable with that obtained with nuclear markers. Their evolutionary relationship with other land snails is also discussed. (AU)^ien.
Descriptores:Caracoles/crecimiento & desarrollo
Gastrópodos/genética
Gastrópodos/crecimiento & desarrollo
Filogenia
ADN Mitocondrial
Perú
Límites:Animales
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rpb/v16n1/a05v16n1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Aguilar, César; Valencia, Niels.
Título:Relaciones filogenéticas entre telmatobiinidos (Anura, Ceratophryidae, Telmatobiinae) de los Andes centrales basado en la morfología de los estados larval y adultos^ies / Phylogenetic relationships between telmatobiinids (Anura, Ceratophryidae, Telmatobiinae) of central Andes based on morphology of larval and adult stages
Fuente:Rev. peru. biol;16(1):43-50, ago. 2009. ^bmapas, ^btab.
Resumen:Batrachophrynus y Telmatobius son los dos únicos géneros reconocidos de Telmatobiinae presentes en los Andes centrales. Las especies de ambos géneros presentan adaptaciones para la vida en la altitud de los Andes siendo de hábitos acuáticos o semiacuáticos en bofedales, riachuelos, lagunas o lagos altoandinos. Este estudio presenta las relaciones filogenéticas entre Batrachophrynus y 13 especies de Telmatobius utilizando caracteres morfológicos larvales y adultos, incluyendo caracteres diagnósticos para Batrachophrynus y Telmatobius, y las sinapomorfías sugeridas para Telmatobius. El análisis filogenético dio como resultado 20 árboles igualmente parsimoniosos con una longitud de 56 pasos. Batrachophrynus forma un grupo monofilético anidado dentro del clado de Telmatobius. En este estudio, la mayoría de sinapomorfías que sustentan a Telmatobius (incluyendo a Batrachophrynus) provienen de la morfología larval y estas sinapomorfías probablemente soporten a todo el género. (AU)^iesBatrachophrynus and Telmatobius are the two genus of Telmatobiinae from the central Andes. Both genera have species with adaptations for life at high altitude in the Andes, with aquatic or semi-aquatic habits in creeks, lagoons and lakes. The objective of this study is to evaluate the phylogenetic relationships between Batrachophrynus and 13 species of Telmatobius from the central Andes using larval and adult morphology including diagnostic characters for Batrachophrynus and Telmatobius, and putative sinapomorphies for Telmatobius. The phylogenetic analysis showed 20 parsimonious trees with 56 steps length. The results of this study hypothesize that the species assigned to Batrachophrynus form a monophyletic group nested within Telmatobius. In this study, most of the synapomorphies that support Telmatobius (including Batrachophrynus) come from larval morphology and these sinapomorphies will probably support the whole genus. (AU)^ien.
Descriptores:Filogenia
Anuros/genética
Ecosistema Andino
Morfología
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rpb/v16n1/a04v16n1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE14.1
Autor:Yábar Varas, Carlos Augusto; Campos B., Yván; Quispe T., Kelly; Carrillo Parodi, Carlos E; Montoya Piedra, Ysabel Catalina.
Título:Análisis genético del virus peruano de la fiebre amarilla^ies / Genetic analysis of the peruvian yellow fever virus
Fuente:Rev. peru. med. exp. salud publica;19(1):28-34, ene.-mar. 2002. ^bilus, ^btab, ^bmapas.
Resumen:Objetivo: Determinar las variantes genéticas de aislamientos del virus peruano de la Fiebre Amarilla (FA). Materiales y métodos: La región carboxiterminal del gen de la envoltura (E) de cinco aislamientos de FA obtenidas de pacientes provenientes de Ayacucho 1978 (PER1), Junín 1995 (PER2), Cerro de Pasco (PER3), Cusco (1998) y San Martín (1999) fue amplificada por PCR, secuenciada y analizada con programas software de ADN. Resultados: El índice de similaridad de la secuencia de aminoácidos presentó valores entre 97,6 por ciento y 99,7 por ciento de similiridad. El análisis filogenético demostró una distancia genética entre 0,40 y 6,50 mediante la secuencia de nucleótidos y, a través de la secuencia de animoácidos se observó un rango de 0,30 y 4,29. Sin embargo, las secuencias correspondientes a los sitios de glicosilación y a los apitopes de reconocimiento humoral fueron conservadas entre los cinco aislamientos, con excepción de algunos aislamientos de referencia reportados por otros autores. Conclusiones: Los virus de FA peruanos forman un grupo filogenético distinto a otros virus de FA sudamericanos, basados en el anáisis genéticos del gen E. (AU)^iesObjective: To determine genetic variants among peruvian Yellow Fever (YF) isolates. Materials and methods: Carboxiterminal ends from the envelope protein gene of five YF isolates obtained from patients living in Ayacucho 1978 (PER1), Junin 1995 (PER2), Cerro de Pasco (PER3), Cusco (1998) y San Martín (1999) were amplified using PCR, and they were sequenced and analyzed using DNA software. Results: The identity index using nucleotide sequences among five yellow fever isolates showed values between 94,3 per cent and 99.3 per cent, while amino acid sequences revealed 97,6 per cent to 99,7 per cent similarity. Likewise, the phylogenetic analysis showed that the values for genetic distance among these isolates were between 0,40 y 6,50 using nucleotide sequences; and using aminoacid sequencing, the range was from 0,30 to 4,29. However, important regions, such as glycosilation sites and humoral-recognising sites were preserved among the five isolates excepting some reference isolates previously reported. Conclusions: Peruvian Yellow Fever viruses are grouped in a phylogenetic cluster different to other South American YF viruses, based on the E gene analysis. (AU)^ien.
Descriptores:Fiebre Amarilla
Fiebre Amarilla/genética
Filogenia
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rins/v19n1/a06v19n1.pdf / es
Localización:PE14.1; PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Mendoza Revilla, Javier.
Título:Aportes de la filogenética a la investigación médica^ies / Contributions of phylogenetics to medical research
Fuente:Rev. méd. hered;23(2):119-127, abr.-jun. 2012. ^bilus.
Resumen:A pesar de su reciente incorporación en la investigación médica, la biología evolutiva ha contribuido significativamente en el entendimiento del origen, desarrollo y mantenimiento de muchas enfermedades importantes para el ser humano. Investigaciones en enfermedades infecciosas, sobretodo en la resistencia contra antibióticos son claros ejemplos de esto. Así mismo, ha cambiando la forma en que vemos y entendemos a nuestro cuerpo, y su vulnerabilidad a ciertos tipos de enfermedades. Otras áreas como el cáncer, enfermedades mentales y envejecimiento han empezado a beneficiarse de la perspectiva evolutiva. Más específicamente, la filogenética como una disciplina de la biología evolutiva, ha mostrado ser una herramienta eficiente para descubrir los orígenes de enfermedades y determinar que cepas poseen mayor probabilidad de propagación. Debido a esto, este artículo tiene como objetivo brindar una idea básica de qué son y cómo interpretar los denominados árboles filogenéticos. Los médicos que puedan entender estos métodos, sin duda, podrán estar mejor preparados para comprender la creciente literatura médica que aborda este tipo de aproximación metodológica que se deriva de la biología evolutiva. (AU)^iesDespite its recent incorporation into medical research, evolutionary biology has contributed significantly in the understanding of the origin, development and maintenance of many important human diseases. Research on infectious diseases, such as antibiotic resistance is a clear example of this. It has also changed the way we see and understand our bodies, as well as their vulnerability to certain types of illnesses. Other areas of research such as cancer therapeutics, mental disorders and aging have begun to benefit from adopting an evolutionary perspective. More precisely, phylogenetics, as a discipline of evolutionary biology, has proved itself an efficient tool for discovering the origins of many diseases and thus determine which strains have higher likelihood of spreading. This article aims to provide a basic understanding of what phylogenetic trees are and how to interpret them. Physicians who can understand these methods will undoubtedly be better prepared to comprehend the growing literature that addresses this type of approach derived from evolutionary biology. (AU)^ien.
Descriptores:Investigación Biomédica
Filogenia
Genética
Medio Electrónico:http://www.upch.edu.pe/vrinve/dugic/revistas/index.php/RMH/article/view/1042/1008 / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Rivera Feijoo, Juan Francisco.
Título:Identidad biológica humana^ies / Human biological identity
Fuente:Rev. peru. psiquiatr;1(1):25-32, ene.-jun. 2010. ^bilus.
Resumen:La perspectiva biológica de la identidad humana identifica a nuestra especie como parte de un proceso de larga evolución. Somos una especie relativamente joven con características distintivas, especialmente con un cerebro que produce una cultura muy modificadora del entorno global, con la que mantiene una intensa relación, con cualidades propias a los homínidos, a los primates y a los mamíferos placentarios. Así mismo, el Homo sapiens porta moléculas y procesos biológicos conservados en cientos de millones de años, confirmados con investigaciones en una representativa y vasta gama de especies. El proceso evolutivo se realiza con modificación en las biomoléculas que repercuten en el organismo entero. Muchas de tales mutaciones son perjudiciales a la supervivencia, pocas son adaptativas. A escala geológica estos últimos cambios van generando transformaciones, que hasta ahora, por el hecho de ser una especie relativamente joven, no alteran nuestra identidad de especie. Podemos sentirnos orgullosos de nuestras capacidades reproductiva y tecnológica, sin embargo estamos obligados a conducirlas de un modo que cuide las condiciones ambientales de supervivencia. La medicina y la antropología aportan en la información, sin embargo, esta mayoritariamente proviene de la paleontología, la biología molecular y la genética. (AU)^iesBiological perspective of human identity identifies our species as part of a long evolution process. We are a relatively young species with distinctive features, especially with a brain that produces a very modifier culture of the global environment, which maintains an intense relationship with hominid, primates and placental mammals qualities. Likewise, Homo sapiens has molecules and biological processes of hundreds of millions of years, confirmed with research in a representative and wide range of species. The evolutionary process is performed for changes in biomolecules that affects the entire organism. Many of these mutations are detrimental to the survival, few are adaptive. At a geological scale these recent changes are generating transformations, so far, but by being a relatively young species, do not alter our species’ identity. We can be proud of our reproductive and technological capabilities, but we are forced to lead them in a way that protecting the environmental conditions of survival. Medicine and anthropology provide the information; however it mostly comes from paleontology, molecular biology and genetics. (AU)^ien.
Descriptores:Filogenia
Primates
Evolución Biológica
Humanos
Medio Electrónico:http://repebis.upch.edu.pe/articulos/rev.peru.psiquiatr/v1n1/a3.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Peña, Carlos.
Título:Métodos de inferencia filogenética^ies / Methods of phylogenetic inference
Fuente:Rev. peru. biol;18(2):265-267, ago. 2011. .
Descriptores:Filogenia
Métodos
Medio Electrónico:http://sisbib.unmsm.edu.pe/bvrevistas/biologia/v18n2/pdf/a23v18n2.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Ramírez Mesías, Rina Lastenia; Borda, Victor; Romero, Pedro; Ramirez, Jorge; Congrains, Carlos; Chirinos, Jenny; Ramírez Roca, Pablo Sergio; Velásquez, Luz Elena; Mejía Carhuanca, Kember Mateo.
Título:Biodiversidad y endemismo de los caracoles terrestres Megalobulimusy Systrophia en la Amazonia occidental^ies / Biodiversity and endemism of the western Amazonia land snails Megalobulimus and Systrophia
Fuente:Rev. peru. biol;19(1):59-74, abr. 2012. ^bilus, ^btab.
Resumen:En este trabajo realizamos un estudio biogeográfico de dos géneros de caracoles terrestres amazónicos, Megalobulimus (Strophocheilidae) y Systrophia (Scolodontidae). Se utilizaron individuos colectados en diversas localidades de la Amazonia peruana así como información bibliográfica. Se utilizaron los marcadores moleculares 5.8S-ITS2-28S rRNA y 16S rRNA para reconstruir filogenias y obtener hipótesis sobre las relaciones evolutivas entre los géneros amazónicos y otras especies de distribución global. La filogenia nuclear permitió determinar la posición evolutiva de ambos géneros y la filogenia mitocondrial permitió la diferenciación de las especies a nivel intragenérico. Megalobulimus formó parte del clado no-achatinoideo en la filogenia de los gastrópodos Stylommatophora, como lo esperado, pero no pudo ser demostrada su cercanía a la familia Acavidae, mientras que Systrophia quedó fuera de los dos clados establecidos, formando uno basal dentro de los Stylommatophora. El gen mitocondrial 16S rRNA permitió diferenciar a las especies de Megalobulimus, actuando como código de barras de ADN de estos caracoles comestibles. El análisis de distribución geográfica reveló varios endemismos para la Amazonia peruana para especies de ambos géneros, resaltando las unidades biogeográficas de Chanchamayo e Inambari. (AU)^iesIn this work we performed a biogeographic study of two genera of Amazonian land snails, Megalobulimus (Strophocheilidae) and Systrophia (Scolodontidae). We used samples from different regions of the Peruvian Amazon, as well as bibliographic information. We analyzed both nuclear (5.8S-ITS2-28S rRNA) and mitochondrial (16S rRNA) genes to reconstruct phylogenies and obtain hypotheses concerning the evolutionary relationships among Amazonian genera and other species with global distribution. The nuclear phylogeny allowed us to determine the evolutionary position of both genera, and the mitochondrial phylogeny permitted the differentiation of species at the intrageneric level. We found that Megalobulimus clustered with the non-achatinoid clade within Stylommatophora, as expected, but its relationship to family Acavidae could not be demonstrated. Systrophiadid not cluster with any of the two established clades, but formed a basal one within Stylommatophora. The mitochondrial gene 16S rRNA allowed us to differentiate Megalobulimus species, and performed well for DNA barcoding of these edible snails. Biogeographical analysis revealed several endemic species in the Peruvian Amazon within both genera, highlighting the Chanchamayo and Inambari biogeographic units. (AU)^ien.
Descriptores:Gastrópodos
Gastrópodos/clasificación
Biodiversidad
Filogenia
ARN Ribosómico 16S
Código de Barras del ADN Taxonómico
Ecosistema Amazónico
Límites:Animales
Medio Electrónico:http://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/rpb/article/view/798/635 / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Scotto Espinoza, Carlos.
Título:Análisis filogenético comparativo entre secuencias codificadoras (Cyt b y ATPasa 8) y secuencias no codificadoras (D-Loop) del ADN mitocondrial de primates y sus implicancias evolutivas en los homínidos^ies / Phylogenetic analysis comparing coding (Cyt b and ATPase 8) and noncoding (D-Loop) sequences of primate mitochondrial dna. Evolutionary consequences in hominids
Fuente:Horiz. méd. (Impresa);6(2):111-129, jul.-dic. 2006. ^bilus, ^btab, ^bgraf.
Resumen:Las secuencias del ADN mitocondrial (ADNmt) de animales vertebrados han sido estudiadas desde hace 25 años. Sólo ahora se cuenta con el genoma mitocondrial completo de muchas especies para hacer un análisis más detallado de cómo evolucionan sus secuencias y como esto influye en la construcción de árboles filogenéticos con la aplicación de los diferentes modelos matemáticos y programas bioinformáticos. En definitiva, aún existe un recurrente debate evolutivo acerca de cuáles secuencias mitocondriales son las más adecuadas de utilizar para explicar mejor los procesos que operan dentro de las especies animales. Por lo tanto, el presente trabajo se propone analizar todas las posibles alternativas de solución utilizando tanto secuencias mitocondriales nucleotídicas como aminoacídicas. (AU)^iesMitochondrial DNA (mtDNA) sequences of vertebrates have been studied for 25 years. Now, we have complete sequences of mitochondrial genomes of many species and this allows a more detailed analysis on the evolution of these sequences and how this influences the construction of phylogenetic trees with the application of different mathematical models and bioinformatics programs. Definitely, an old evolutionary discussion has come back about which mitochondrial sequences are the most appropriate to use in order to explain the processes operating within animal species. Therefore, the aim of this paper is to analyze all these possible alternatives using mitochondrial nucleotide and amino acid sequences. (AU)^ien.
Descriptores:Filogenia
ADN Mitocondrial
Análisis de Secuencia de ADN
Primates
Evolución Biológica
Hominidae
Medio Electrónico:http://www.medicina.usmp.edu.pe/horizonte/2006_II/Art8_Vol6_N2.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE13.1
Autor:Cruz Malpica, Cristhopher Donat's
Orientador:Monteghirfo Gomero, Mario
Título:Caracterización molecular de cepas aisladas de dengue 2 en Perú; 2000-2010^ies Molecular characterization of isolates strains of dengue 2 in Peru; 2000-2010-
Fuente:Lima; s.n; 2013. 72 ilus, tab, graf.
Tese:Presentada la Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Medicina para obtención del grado de Maestría.
Resumen:El virus Dengue (VDEN) es el responsable de más de 50-100 millones de casos anualmente en el mundo. La infección del dengue es causada por cuatro serotipos (VDEN-1, VDEN-2, VDEN-3 y VDEN-4) y el espectro de la enfermedad varía desde una fiebre indiferenciada, fiebre hemorrágica por dengue (FHD), síndrome de shock por dengue, y muerte. Información epidemiológica liga el desarrollo de FHD con una infección secundaria y además sugiere que ciertas cepas son más virulentas que otras. En 2001, aparecieron los primeros casos de FHD asociados con VDEN-2 en la costa del Perú. En el 2010 ocurrió un brote en Iquitos con casos severos convirtiéndose en el más largo en la historia de la región. Sin embargo estudios orientados en determinar el origen distribución y diversidad genética de cepas peruanas de VDEN-2 durante los diez últimos años no han sido realizados. Para atender este vacío de conocimiento en la epidemiología del VDEN-2 en Perú, extractos de ARN de 30 aislamientos virales en células C6/36 (Aedes albopictus) fueron procesados por RT-PCR. Secuencias del gen de la envoltura (E) fueron determinadas y comparadas con muestras globales de VDEN-2. El análisis filogenético reveló la circulación de dos genotipos en Perú: Americano (hasta el 2000) y Americano/Asiático (2000-2010). Adicionalmente se identificaron cepas variantes del genotipo Americano/Asiático distribuidos en dos clados principales (1 y 2) que ingresaron al Perú por la costa norte (Ecuador) y por la selva (Brasil o Bolivia). Con el aparente incremento de la virulencia relacionada a cepas Americano/Asiático del clado 2, nuestros resultados soportan la necesidad de un continuo monitoreo de cepas emergentes de nuevos variantes o genotipos de dengue que podrían estar asociados a casos severos de la enfermedad. (AU)^iesDengue virus (DENV) is responsible for more than 50-100 million cases annually throughout the world. Dengue infection is caused by four different dengue serotypes (DENV-1, DENV-2, DENV-3, and DENV-4) and the clinical spectrum of disease ranges from dengue fever, dengue hemorrhagic fever (DHF), dengue shock syndrome, and death. Epidemiological information has linked the development of DHF with secondary dengue infections and has also suggested that certain DENV strains are more virulent than others. In 2001, the first DHF cases associated with DENV-2 virus were recognized in the coastal region of Peru. In 2010 severe cases from an outbreak in Iquitos were registered; and resulted in the largest DHF epidemic that region had ever experience. However, studies to address the origins, distribution, and genetic diversity of Peruvian DENV-2 strains from the last ten years have not been performed. To address this knowledge gap, RNA extracted from 30 viruses isolated in C6/36 (Aedes albopictus) cells were performed by RT-PCR. The envelope (E) sequences were determined and used in a phylogenetic comparison with a global sample of DENV-2 viruses. Phylogenetic analysis confirmed the circulation of two DENV-2 genotypes in Peru: American (prior to 2001) and American/Asian (2000-2010). Additionally we identified American/Asian genotype variants from two clades (1 and 2) were introduced into Peru from the north (Ecuador) and the east (Brazil or Bolivia). In light of evidence for increased virulence of clade 2, our results support the need for continuous monitoring for emerging strains of new DENV variants or genotypes that may be associated with severe disease. (AU)^ien.
Descriptores:Dengue/clasificación
Arbovirus/genética
Arbovirus/aislamiento & purificación
Virus del Dengue/genética
Virus del Dengue/aislamiento & purificación
Filogenia
Localización:PE13.1; MG, WC, 528, C92, ej.1. 010000096719; PE13.1; MG, WC, 528, C92, ej.2. 010000096720

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Id:PE14.1
Autor:Tarazona Jurado, David Demetrio; Galarza Perez, Marco Antonio; Levano, Kelly S; Guio Chunga, Heinner Hilario.
Título:Réplica al comentario sobre artículo: análisis genómico comparativo de cepas peruanas de Mycobacterium tuberculosis^ies / Response to a commebt on: comparative genomic analysis of peruvian strains of Mycobacterium tuberculosis
Fuente:Rev. peru. med. exp. salud publica;33(4):835-836, oct.-dic. 2016. .
Descriptores:Genómica
Análisis de Secuencia de ADN
Mycobacterium tuberculosis
Allium cepa (Homeopatía)
Filogenia
Límites:Humanos
Medio Electrónico:http://www.rpmesp.ins.gob.pe/index.php/rpmesp/article/view/2578/2475 / es
Localización:PE14.1



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